222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_478 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  100 
 
 		 176 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  96.59 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  93.18 
 
 		 176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  47.93 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  42.77 
 
 		 173 aa  148  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  49.66 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.79 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  44.79 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  44.79 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.17 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  39.52 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  40.46 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  44.51 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  42.01 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44.85 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  43.56 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  45.4 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  45.12 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  43.56 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 204 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  43.9 
 
 		 187 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  42.94 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 171 aa  130  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40.48 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  39.15 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  45.89 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  44.17 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  39.15 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.89 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  44.17 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.29 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  43.9 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  36.57 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  40.12 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  42.33 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 197 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  41.72 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.9 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 213 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  43.97 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  40.54 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  43.57 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  47.18 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  40.12 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  43.45 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  41.43 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  34.22 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  39.51 
 
 		 199 aa  104  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  36.32 
 
 		 205 aa  103  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  38.79 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  41.5 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  41.26 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  35.75 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 220 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  36.57 
 
 		 185 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  35.5 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  36.57 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  36.75 
 
 		 205 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  38.78 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  36.31 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  34.52 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  38.26 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  36.31 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  35.54 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  38 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  39.31 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  40.69 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  35.12 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  37.33 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  37.33 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  41.26 
 
 		 200 aa  94.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 169 aa  94.4  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  37.76 
 
 		 185 aa  94  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  35.54 
 
 		 222 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  35.54 
 
 		 222 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  35.54 
 
 		 222 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  38.06 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  39.6 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>