234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3910 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  100 
 
 
177 aa  350  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  97.74 
 
 
177 aa  342  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  68.52 
 
 
177 aa  228  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  63.25 
 
 
171 aa  208  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  62.26 
 
 
173 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  59.06 
 
 
178 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  57.86 
 
 
180 aa  190  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  64.42 
 
 
186 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  58.86 
 
 
166 aa  171  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  54.04 
 
 
169 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  55 
 
 
169 aa  170  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  50.9 
 
 
184 aa  168  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  53.09 
 
 
166 aa  168  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  52.8 
 
 
205 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  54.32 
 
 
196 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  51.88 
 
 
221 aa  164  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  51.88 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  50.96 
 
 
166 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  51.59 
 
 
166 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  51.88 
 
 
222 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  51.88 
 
 
222 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  51.88 
 
 
222 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  52.5 
 
 
169 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  53.29 
 
 
220 aa  158  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  50.29 
 
 
182 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  50.62 
 
 
222 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  51.25 
 
 
183 aa  151  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  48.43 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  48 
 
 
171 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  46.67 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  46.67 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.35 
 
 
174 aa  138  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  54.86 
 
 
199 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  44.38 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  50.3 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  50.36 
 
 
173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  47.4 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  51.03 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40.83 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  48.55 
 
 
162 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  47.27 
 
 
174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  50.36 
 
 
174 aa  127  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  45.52 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  51.09 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  42.67 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  45.65 
 
 
168 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  47.48 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  47.48 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  47.1 
 
 
165 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  45.65 
 
 
168 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  44.08 
 
 
167 aa  124  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  48.23 
 
 
187 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  43.64 
 
 
213 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  42.67 
 
 
168 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  39.26 
 
 
169 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  40.4 
 
 
170 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  47.48 
 
 
185 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  50.39 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  40 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  47.52 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  47.48 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  46.76 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  40.48 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  46.15 
 
 
189 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  45.64 
 
 
160 aa  117  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  44.6 
 
 
165 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  45.65 
 
 
174 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  42.75 
 
 
168 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  46.83 
 
 
174 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  39.38 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  38.55 
 
 
169 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  42.17 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  42.17 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  41.43 
 
 
176 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  47.14 
 
 
148 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  43.57 
 
 
176 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  44.6 
 
 
146 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  41.94 
 
 
181 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  42.86 
 
 
177 aa  105  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  41.55 
 
 
152 aa  104  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  40.48 
 
 
194 aa  104  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  41.96 
 
 
167 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  37.72 
 
 
198 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  42.14 
 
 
186 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  45.04 
 
 
139 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.51 
 
 
204 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  37.58 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  39.11 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  40.24 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  40.24 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  41.32 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  39.76 
 
 
189 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  40.23 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  36.53 
 
 
198 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  39.66 
 
 
183 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  41.04 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  39.55 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  39.73 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  41.35 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  39.16 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>