238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3308 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  100 
 
 
211 aa  441  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  79.01 
 
 
188 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  77.9 
 
 
188 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  70.69 
 
 
185 aa  268  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  69.1 
 
 
186 aa  268  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  68.57 
 
 
186 aa  265  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  64.94 
 
 
185 aa  258  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  66.67 
 
 
185 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  67.23 
 
 
190 aa  257  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  64.94 
 
 
216 aa  256  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  66.67 
 
 
190 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  66.09 
 
 
185 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  66.09 
 
 
185 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  65.52 
 
 
185 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  64.94 
 
 
185 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  66.67 
 
 
190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  65.52 
 
 
185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  65.71 
 
 
189 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  64.57 
 
 
189 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  64.94 
 
 
185 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  64.37 
 
 
191 aa  246  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  62.64 
 
 
185 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  63.79 
 
 
196 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  62.84 
 
 
188 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  62.36 
 
 
187 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  63.54 
 
 
186 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  62.36 
 
 
186 aa  238  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  60.89 
 
 
198 aa  236  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  60.34 
 
 
194 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  61.14 
 
 
194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  58.38 
 
 
198 aa  232  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  57.84 
 
 
194 aa  228  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  57.63 
 
 
198 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  55.93 
 
 
183 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  55.93 
 
 
182 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  55.37 
 
 
183 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  55.93 
 
 
182 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  55.93 
 
 
182 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  55.37 
 
 
182 aa  204  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  55.93 
 
 
178 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  53.96 
 
 
139 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  48.23 
 
 
145 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  40.56 
 
 
174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.75 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  45.95 
 
 
189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.95 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  40.59 
 
 
172 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  37.21 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  35.83 
 
 
197 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40.97 
 
 
171 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  34.48 
 
 
174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  38.86 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  41.96 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  37.79 
 
 
174 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  41.07 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  41.07 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  44.06 
 
 
187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  43.36 
 
 
185 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  39.53 
 
 
174 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  40.12 
 
 
173 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  42.07 
 
 
185 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  39.29 
 
 
165 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  44.29 
 
 
204 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  39.88 
 
 
174 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  43.57 
 
 
198 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  43.57 
 
 
198 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  43.15 
 
 
174 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  38.19 
 
 
169 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  37.5 
 
 
165 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  46.15 
 
 
205 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  39.73 
 
 
177 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  42.03 
 
 
198 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  41.26 
 
 
168 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  41.26 
 
 
168 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  37.08 
 
 
213 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  39.77 
 
 
165 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  38.41 
 
 
167 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.9 
 
 
165 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  44.36 
 
 
197 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  42.07 
 
 
185 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  36.36 
 
 
170 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  41.1 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  34.12 
 
 
170 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  38.62 
 
 
168 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  40.69 
 
 
167 aa  98.6  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  37.09 
 
 
169 aa  98.2  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  40.14 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  38.46 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  36.81 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  34.3 
 
 
170 aa  95.9  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  38.06 
 
 
162 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  38.46 
 
 
177 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  38.97 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  37.24 
 
 
169 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  35.67 
 
 
166 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  35.57 
 
 
177 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  38.04 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  33.14 
 
 
181 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  37.25 
 
 
169 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  36.31 
 
 
177 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>