287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1537 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  100 
 
 		 178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  61.08 
 
 		 173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  63.12 
 
 		 171 aa  214  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  60.51 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  59.06 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  59.06 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  57.23 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  55.21 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  57.41 
 
 		 196 aa  180  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  60.84 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  54.37 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  52.8 
 
 		 222 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  52.8 
 
 		 222 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  52.8 
 
 		 222 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  53.42 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  50.93 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  55.7 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  52.8 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  53.75 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  46.89 
 
 		 221 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  51.9 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  52.56 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  48.12 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.36 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  48.1 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  44.51 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.68 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  53.18 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  41.61 
 
 		 165 aa  134  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  43.11 
 
 		 167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  43.03 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  40.99 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  41.61 
 
 		 165 aa  128  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  43.12 
 
 		 199 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  42.07 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  46.53 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  41.14 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  40.37 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  36.14 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.9 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.92 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.52 
 
 		 168 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  46.48 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  43.84 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  36.53 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  44.68 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  33.13 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.79 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  41.14 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  37.13 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  39.88 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  38.89 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  42.48 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  39.51 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.88 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  39.63 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  45 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  39.72 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.61 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  36.81 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  40 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  35.54 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  37.42 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  37.41 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  41.96 
 
 		 148 aa  94.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  40.54 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  39.86 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  39.86 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  37.24 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  33.99 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  35 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  31.72 
 
 		 204 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  38.19 
 
 		 152 aa  87.8  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  31.49 
 
 		 205 aa  87.8  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  38.6 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  39.86 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  34.64 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  34.71 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  31.18 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>