225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2032 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  73.99 
 
 		 196 aa  271  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  65.28 
 
 		 222 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  65.28 
 
 		 222 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  65.28 
 
 		 222 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  64.55 
 
 		 221 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  62.76 
 
 		 222 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  65.76 
 
 		 220 aa  258  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  66.08 
 
 		 220 aa  236  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  65.48 
 
 		 169 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  67.47 
 
 		 166 aa  232  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  66.07 
 
 		 169 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  63.1 
 
 		 169 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  61.59 
 
 		 184 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  58.62 
 
 		 183 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  54.94 
 
 		 180 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  51.55 
 
 		 171 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  51.55 
 
 		 173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  54.94 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  54.04 
 
 		 177 aa  168  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  52.8 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  54.04 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  49.4 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  50.26 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  47.59 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  46.39 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  45.78 
 
 		 168 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.78 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  43.83 
 
 		 166 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  51.85 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.56 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 174 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  43.56 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  38.79 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  42.77 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  42.77 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.37 
 
 		 168 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  43.66 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  40.36 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  36.53 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  44.85 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  38.12 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  44.83 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  40.36 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  39.29 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  37.64 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  40.36 
 
 		 165 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  44.14 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  38.41 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.17 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  41.96 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  33.53 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.75 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  44.94 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  41.55 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  36.63 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  39.63 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  39.13 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  36.63 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  39.86 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  36.63 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  35.93 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  40.69 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  39.86 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  42.25 
 
 		 152 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  39.6 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  41.55 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  35.12 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  37.36 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  37.59 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  35.83 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  37.57 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  36.75 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  40.69 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 189 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  36.75 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  35.54 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  36.55 
 
 		 185 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  38.67 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  36.91 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  37.24 
 
 		 185 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  33.14 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  39.46 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  40.3 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  45.05 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  38.28 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  43.61 
 
 		 178 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  36.55 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  39.84 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>