219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12494 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  69.82 
 
 
220 aa  318  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  72.05 
 
 
222 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  72.05 
 
 
222 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  72.05 
 
 
222 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  71.17 
 
 
221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  74.57 
 
 
196 aa  278  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  62.76 
 
 
205 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  69.01 
 
 
220 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  69.88 
 
 
166 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  63.1 
 
 
169 aa  228  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  63.1 
 
 
169 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  61.9 
 
 
169 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  60.95 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  58.79 
 
 
184 aa  207  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  51.55 
 
 
171 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  50 
 
 
173 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  53.42 
 
 
178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  51.25 
 
 
180 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  51.25 
 
 
177 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  52.5 
 
 
177 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  50.61 
 
 
182 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  53.61 
 
 
200 aa  154  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  50.62 
 
 
177 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  48.8 
 
 
166 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  47.27 
 
 
164 aa  141  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  45.71 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  51.25 
 
 
186 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  46.99 
 
 
166 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.42 
 
 
174 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.78 
 
 
166 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  43.37 
 
 
168 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  43.37 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  43.37 
 
 
213 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  40.12 
 
 
171 aa  128  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  42.77 
 
 
165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  44.38 
 
 
165 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  42.77 
 
 
165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  42.96 
 
 
168 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  42.96 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.37 
 
 
172 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  40.85 
 
 
162 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  40.36 
 
 
168 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  43.37 
 
 
165 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  45.07 
 
 
174 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  39.88 
 
 
187 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  43.66 
 
 
168 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  45.77 
 
 
189 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  41.1 
 
 
166 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  43.66 
 
 
174 aa  121  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  44.31 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  40.96 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  42.42 
 
 
167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  45.77 
 
 
165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  39.29 
 
 
185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.13 
 
 
170 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  39.29 
 
 
185 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  39.29 
 
 
185 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  39.88 
 
 
165 aa  118  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  40.48 
 
 
168 aa  118  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  46.91 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  44 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  41.32 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  45.21 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  44.68 
 
 
160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  39.29 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  37.06 
 
 
171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  40.67 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  40.28 
 
 
170 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  45.77 
 
 
152 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  35.98 
 
 
198 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  44.52 
 
 
146 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  41.79 
 
 
198 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  40.24 
 
 
174 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  41.38 
 
 
194 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  40.28 
 
 
181 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  41.38 
 
 
194 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  37.5 
 
 
169 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  40.82 
 
 
185 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  38.65 
 
 
185 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.22 
 
 
177 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  34.52 
 
 
169 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  40.41 
 
 
179 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  47.26 
 
 
148 aa  99.8  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  40.14 
 
 
185 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  38.75 
 
 
185 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  39.58 
 
 
167 aa  99.8  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  41.38 
 
 
178 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  40 
 
 
196 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  38.01 
 
 
188 aa  98.6  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  37.74 
 
 
191 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  37.43 
 
 
194 aa  98.2  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  38.36 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  33.55 
 
 
169 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  38.1 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  37.79 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  41.35 
 
 
189 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  48.54 
 
 
139 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  42.54 
 
 
189 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  41.06 
 
 
182 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>