233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  100 
 
 		 166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  78.92 
 
 		 220 aa  271  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  70.48 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  70.48 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  70.48 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  69.88 
 
 		 222 aa  249  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  67.47 
 
 		 220 aa  250  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  66.87 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  68.67 
 
 		 196 aa  246  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  67.47 
 
 		 205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  66.87 
 
 		 169 aa  231  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  65.66 
 
 		 169 aa  230  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  63.86 
 
 		 169 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  63.86 
 
 		 183 aa  221  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  62.35 
 
 		 184 aa  217  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 171 aa  184  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 173 aa  183  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  55.21 
 
 		 178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  53.75 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  53.09 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  53.7 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  51.25 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  51.85 
 
 		 182 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  49.39 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  55.28 
 
 		 200 aa  158  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  46.25 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.73 
 
 		 197 aa  140  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  51.25 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  45.73 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  46.71 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  42.68 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  41.21 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  43.03 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  43.03 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  43.03 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  44.24 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  41.46 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  45.39 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  45.39 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  42.51 
 
 		 213 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  43.97 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  43.97 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  43.51 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  45 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  43.03 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  44.68 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  42.55 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  39.88 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  46.48 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  38.79 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  45.14 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.01 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  44.68 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  42.25 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.98 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.97 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  42.25 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  40.49 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  42.51 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  43.06 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  41.78 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  38.79 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  42.36 
 
 		 198 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  47.26 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  35.47 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  41.43 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  38.73 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  36.91 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  40.28 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  43.28 
 
 		 198 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  36.81 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  38.67 
 
 		 145 aa  97.4  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  37.34 
 
 		 198 aa  97.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  37.89 
 
 		 188 aa  97.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  44.36 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  43.85 
 
 		 189 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  37.95 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  40.31 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  36.55 
 
 		 185 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  37.41 
 
 		 187 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  38.03 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  36.55 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 196 aa  91.3  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  38.73 
 
 		 177 aa  90.9  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>