256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3733 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  70.62 
 
 		 186 aa  267  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  67.23 
 
 		 186 aa  254  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  63.89 
 
 		 186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  63.24 
 
 		 185 aa  250  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  63.89 
 
 		 189 aa  248  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  63.04 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  62.22 
 
 		 188 aa  247  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  61.75 
 
 		 186 aa  247  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  61.62 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  61.62 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  62.7 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  60.75 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  61.41 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  62.15 
 
 		 198 aa  244  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  62.5 
 
 		 189 aa  243  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  62.5 
 
 		 190 aa  243  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  59.89 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  60.87 
 
 		 191 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  60.54 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  59.89 
 
 		 185 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  61.96 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  61.11 
 
 		 188 aa  241  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  62.71 
 
 		 198 aa  241  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  59.36 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  59.78 
 
 		 196 aa  240  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  58.6 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  62.36 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  60.87 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  59.89 
 
 		 194 aa  234  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  59.66 
 
 		 182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  59.66 
 
 		 182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  59.89 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  59.89 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  59.66 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  59.66 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  57.95 
 
 		 182 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  59.66 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  59.66 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  59.22 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  55.32 
 
 		 139 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  47.25 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  57.81 
 
 		 145 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  41.18 
 
 		 165 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  50 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  41.76 
 
 		 165 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  43.79 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  40.12 
 
 		 171 aa  121  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.6 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.79 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  41.04 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  38.76 
 
 		 213 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40.59 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  39.11 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  39.77 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  40.59 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40.59 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  38.98 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  40.7 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  35.15 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.41 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  40.41 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  38.46 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  39.18 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  40.76 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  38.46 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  37.5 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  39.41 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  39.41 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  39.41 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  39.67 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  37.29 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 169 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  39.67 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  36.63 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  43.84 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  39.18 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  41.61 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  42.14 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  33.15 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  41.89 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  39.46 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  38.62 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  36.42 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  41.5 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  39.46 
 
 		 162 aa  98.6  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  40.82 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  45.21 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  36.31 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  36.87 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 177 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  37.89 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  36.14 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  36.14 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  36.14 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>