243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0798 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  100 
 
 
166 aa  342  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  93.98 
 
 
166 aa  324  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  64.38 
 
 
166 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  60 
 
 
164 aa  200  9e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  51.59 
 
 
177 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  51.59 
 
 
177 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  48.1 
 
 
177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  47.13 
 
 
171 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  47.77 
 
 
173 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  46.25 
 
 
166 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  44.3 
 
 
180 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  46.67 
 
 
222 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  46.67 
 
 
222 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  45.56 
 
 
196 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  46.67 
 
 
222 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  46.67 
 
 
178 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  46.43 
 
 
169 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  50.62 
 
 
200 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  45.06 
 
 
169 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  45.96 
 
 
182 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  46.25 
 
 
184 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  46.99 
 
 
222 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  44.64 
 
 
220 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  43.83 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  43.11 
 
 
169 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  44.64 
 
 
221 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  44.79 
 
 
220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  44.38 
 
 
183 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  47.2 
 
 
174 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  45.06 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  39.26 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  43.48 
 
 
173 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  43.75 
 
 
189 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  46.5 
 
 
186 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  44.14 
 
 
165 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  44.83 
 
 
165 aa  122  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.29 
 
 
168 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.29 
 
 
168 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.04 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  45.83 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  44.44 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  44.44 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  40.72 
 
 
174 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  47.89 
 
 
146 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  43.87 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.32 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  43.87 
 
 
197 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.45 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  41.38 
 
 
168 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  43.06 
 
 
174 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  46.53 
 
 
167 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  42.14 
 
 
187 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  42.07 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  45.99 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  42.36 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  42.58 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.13 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  41.67 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  40.85 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  44.68 
 
 
160 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  43.54 
 
 
177 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.66 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  45 
 
 
181 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.4 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  41.43 
 
 
185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  41.43 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.19 
 
 
168 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  41.43 
 
 
185 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  41.4 
 
 
199 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  46.81 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  38.51 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  40.14 
 
 
167 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  38.75 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  33.13 
 
 
170 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.51 
 
 
177 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  37.32 
 
 
169 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  40 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  36.09 
 
 
198 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  40.69 
 
 
176 aa  97.1  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  38.93 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  39.31 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  39.31 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  38.55 
 
 
198 aa  95.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  38.19 
 
 
198 aa  94.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  38.73 
 
 
194 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  38.73 
 
 
194 aa  94  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  34.95 
 
 
204 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  38.46 
 
 
185 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  38.73 
 
 
194 aa  90.5  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  38.64 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  34.39 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  42.31 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  37.69 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.69 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  39.23 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  39.23 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  35.67 
 
 
211 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  37.34 
 
 
186 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  37.87 
 
 
188 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  37.5 
 
 
145 aa  88.6  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>