228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14600 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  100 
 
 
145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  55.86 
 
 
186 aa  165  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  57.81 
 
 
187 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  53.33 
 
 
191 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  52.59 
 
 
185 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  56.25 
 
 
186 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  50.68 
 
 
196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  52.41 
 
 
194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  51.03 
 
 
198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  52.41 
 
 
194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  53.73 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  51.72 
 
 
194 aa  144  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  54.2 
 
 
190 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  50.68 
 
 
186 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  54.2 
 
 
190 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  50.38 
 
 
185 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  51.13 
 
 
185 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  55.12 
 
 
189 aa  143  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  51.13 
 
 
185 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  53.91 
 
 
186 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  54.2 
 
 
190 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  52.99 
 
 
185 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  49.66 
 
 
188 aa  140  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  51.85 
 
 
216 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  52.76 
 
 
189 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  50.34 
 
 
198 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  54.26 
 
 
185 aa  139  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  51.03 
 
 
188 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  52.34 
 
 
185 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  52.34 
 
 
185 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  53.12 
 
 
183 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  53.12 
 
 
183 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  53.49 
 
 
185 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  53.12 
 
 
182 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  53.12 
 
 
182 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  53.12 
 
 
182 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  52.34 
 
 
182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  47.26 
 
 
188 aa  130  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  48.23 
 
 
211 aa  130  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  51.54 
 
 
178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  48.44 
 
 
198 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  46.9 
 
 
174 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  36.3 
 
 
171 aa  104  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  40 
 
 
166 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  44.12 
 
 
189 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.17 
 
 
168 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  43.08 
 
 
169 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40.94 
 
 
171 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  37.78 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  41.38 
 
 
170 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  38 
 
 
165 aa  98.2  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  40.69 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  48.11 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  38.67 
 
 
166 aa  97.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  35.86 
 
 
174 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  39.31 
 
 
189 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  41.35 
 
 
165 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  41.35 
 
 
167 aa  95.9  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  36.99 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  37.67 
 
 
197 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.5 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  41.38 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.84 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  40.62 
 
 
174 aa  94  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  40.88 
 
 
220 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  39.04 
 
 
174 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.16 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  37.93 
 
 
187 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  40.88 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  39.31 
 
 
174 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  36.76 
 
 
205 aa  91.3  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  39.33 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  37.24 
 
 
185 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  39.06 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  39.06 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  42.34 
 
 
169 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  39.74 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  39.06 
 
 
185 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  40.29 
 
 
169 aa  90.1  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  37.41 
 
 
213 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  40.82 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  40.15 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  38.69 
 
 
220 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  38.1 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  38.69 
 
 
222 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  38.69 
 
 
222 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  38.69 
 
 
222 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  37.5 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  37.96 
 
 
221 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  38.97 
 
 
182 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  35.86 
 
 
177 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  37.01 
 
 
169 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  36.76 
 
 
177 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  37.24 
 
 
185 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  38.78 
 
 
222 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  35.26 
 
 
204 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  36.76 
 
 
166 aa  87  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  35.26 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  35.26 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  37.41 
 
 
184 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>