207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1393 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  70.31 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  70.31 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  70.31 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  72.57 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  71.43 
 
 		 220 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  74.57 
 
 		 222 aa  278  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  73.99 
 
 		 205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  68.67 
 
 		 166 aa  246  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  64.33 
 
 		 220 aa  240  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  63.1 
 
 		 169 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  64.29 
 
 		 169 aa  227  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  62.5 
 
 		 169 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  58.01 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  60.37 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  55.21 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  54.04 
 
 		 173 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  57.41 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  54.94 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  54.66 
 
 		 180 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  54.32 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  56.63 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  51.88 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  50.61 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  48.19 
 
 		 164 aa  148  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  49.38 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.66 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  45.56 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  52.8 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  44.58 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  44.58 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  43.98 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  44.58 
 
 		 165 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  43.98 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  41.07 
 
 		 168 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  42.77 
 
 		 174 aa  128  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  47.59 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  45.77 
 
 		 165 aa  127  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  40.48 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  46.58 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  42.94 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  46.21 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  45.77 
 
 		 165 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  41.32 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  42.48 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  45.77 
 
 		 168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  40.48 
 
 		 162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  41.18 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  45.52 
 
 		 152 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40.52 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  40.52 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  38.18 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  42.68 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  43.45 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  42.76 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.09 
 
 		 170 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  42.96 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  41.5 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  43.24 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  47.95 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  37.95 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  37.58 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  39.16 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.73 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  39.26 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.22 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  36.53 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  43.94 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  34.52 
 
 		 176 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  35.12 
 
 		 177 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 169 aa  98.2  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  38.82 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  40.28 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  35.03 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  40.97 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  44.36 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  40.3 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  42 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  38.51 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  39.85 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>