195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0267 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  407  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  75.92 
 
 
193 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  69.15 
 
 
196 aa  284  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  67.02 
 
 
194 aa  277  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  65.1 
 
 
199 aa  269  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  53.67 
 
 
189 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  48.92 
 
 
204 aa  185  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  49.46 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  51.1 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  48.86 
 
 
181 aa  181  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  49.44 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  49.44 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  48.9 
 
 
220 aa  178  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  50 
 
 
185 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  50.27 
 
 
185 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  47.8 
 
 
185 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  47.8 
 
 
185 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  47.8 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  47.25 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  46.7 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  43.09 
 
 
189 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  49.14 
 
 
184 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  46.15 
 
 
185 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  46.15 
 
 
185 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  44.15 
 
 
202 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  40.33 
 
 
189 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  42.86 
 
 
185 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  45.76 
 
 
191 aa  154  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  43.33 
 
 
193 aa  148  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  42.47 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  38.71 
 
 
187 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  38.31 
 
 
176 aa  89  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  48.15 
 
 
166 aa  88.6  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  37.82 
 
 
177 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  34.78 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  37.18 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  33.33 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  34.57 
 
 
174 aa  85.1  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  31.74 
 
 
168 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  33.33 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  46.34 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  45.24 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  45.24 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.86 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  45.24 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  48.68 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  42.31 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  34.94 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  48.68 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  45.35 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  35.14 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  43.59 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  33.75 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  40.96 
 
 
168 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.44 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  46.15 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  46.59 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  45.12 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  43.53 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  45.24 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  49.3 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  44.87 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  31.15 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  41.24 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  44.16 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  42.53 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  41.67 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  42.86 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.9 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  46.75 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  47.3 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  41.35 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  46.59 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  47.3 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  47.37 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  46.75 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  47.3 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  47.3 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  48.68 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  41.35 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  39.42 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  41.35 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  47.3 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  49.33 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  45.33 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  42.31 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  38 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  44.16 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  30.49 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  35.11 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  44 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  39.58 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  45.35 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  42.11 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  45.33 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  42.11 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  42.68 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  40.7 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>