195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1270 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  100 
 
 		 186 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  86.41 
 
 		 185 aa  347  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  85.41 
 
 		 185 aa  337  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  85.79 
 
 		 185 aa  336  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  83.06 
 
 		 185 aa  335  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  83.06 
 
 		 185 aa  335  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  84.15 
 
 		 185 aa  332  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  81.97 
 
 		 185 aa  325  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  75.27 
 
 		 202 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  57.07 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  51.61 
 
 		 189 aa  207  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  51.37 
 
 		 189 aa  204  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  51.63 
 
 		 187 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  50 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  48.9 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  48.09 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  46.29 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  45.36 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  47.46 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  47.8 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  46.45 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  44.09 
 
 		 194 aa  170  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  45.99 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  46.11 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  47.19 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  47.19 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  43.62 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  45.66 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  40.46 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  37.09 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  33.11 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  34 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  48.19 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  37 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  37.19 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  33.54 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  48.81 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  38.52 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  48.78 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  37 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  37 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  38.46 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  40 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  36.17 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  46.75 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.44 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  31.87 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  36.22 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  32.45 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  40.78 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  32.14 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  41.3 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  41.3 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  45 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  29.56 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  39 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  32.52 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  46.43 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  33.55 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  30 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  35.77 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  31.82 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  43.9 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  41 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  29.81 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  41 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  29.38 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  43.9 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  32.05 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  35.46 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  47.56 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  31.82 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  35.65 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  34.87 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44.71 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  36.94 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  32.12 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  31.68 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  34.19 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  33.54 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>