14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1129 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1129  HNH endonuclease  100 
 
 
271 aa  554  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497129  unclonable  0.00000789585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  28.32 
 
 
168 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  41.27 
 
 
552 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2241  HNH endonuclease  44.9 
 
 
122 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  40.62 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  35.29 
 
 
1187 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.94 
 
 
177 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2249  HNH endonuclease  42.86 
 
 
121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2895  HNH endonuclease  42.86 
 
 
121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896232 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  31.39 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  30 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  36.92 
 
 
127 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  29.08 
 
 
459 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  30.21 
 
 
176 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>