125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0328 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  100 
 
 
122 aa  245  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  72.53 
 
 
138 aa  140  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  69.66 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  70.79 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  69.66 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  69.66 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  68.89 
 
 
146 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  71.59 
 
 
149 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  64.71 
 
 
113 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  50.75 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  37.35 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  48.33 
 
 
427 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  39.76 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.86 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.86 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  43.59 
 
 
96 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  35.87 
 
 
471 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  46.67 
 
 
459 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  44.44 
 
 
435 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  44.64 
 
 
135 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  43.55 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  43.55 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  42.11 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  40 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  40.38 
 
 
477 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  45.16 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  38.36 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  35 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  42.86 
 
 
481 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.35 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  44.44 
 
 
459 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  43.33 
 
 
454 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  38.89 
 
 
427 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  42.86 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  42.86 
 
 
464 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  40 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  42.19 
 
 
459 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  36.36 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  43.33 
 
 
422 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  44.26 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  32.61 
 
 
461 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  38.46 
 
 
452 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.18 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  54.76 
 
 
186 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  47.69 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  53.49 
 
 
185 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  51.16 
 
 
443 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4124  HNH nuclease  38.46 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000599297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  35.71 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  50 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  50 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  44.19 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  36.67 
 
 
438 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  51.16 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  40.68 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  46 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  46 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  50 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  55.81 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  53.66 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.29 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  53.33 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  48.84 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.29 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  39.06 
 
 
465 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  53.49 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  51.16 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  33.93 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  54.9 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.44 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  44.68 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  39.02 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  51.16 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.18 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  51.16 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.44 
 
 
168 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2805  hypothetical protein  32.79 
 
 
234 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.4769199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  48.78 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  42.11 
 
 
552 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  37.5 
 
 
465 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  48.84 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  44.44 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  51.11 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  50 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  46.51 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  53.66 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  48.84 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  53.66 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  34.62 
 
 
427 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  51.22 
 
 
165 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  51.22 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  50 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  51.11 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  51.11 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  51.11 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  48.78 
 
 
191 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  46.51 
 
 
174 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  35.71 
 
 
165 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  40.3 
 
 
222 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  40.3 
 
 
222 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>