137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_10581 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  100 
 
 
113 aa  237  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  97.35 
 
 
113 aa  233  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  90.18 
 
 
113 aa  216  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  85.84 
 
 
113 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  63.96 
 
 
131 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  63.06 
 
 
136 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  61.26 
 
 
135 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  60.18 
 
 
133 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  59.29 
 
 
133 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  59.46 
 
 
133 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  58.41 
 
 
133 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  58.56 
 
 
136 aa  151  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  60.18 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  57.66 
 
 
136 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  39.56 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  38.89 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  35.37 
 
 
200 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  43.33 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  38.57 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  44.23 
 
 
196 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  44.23 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  38.89 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  38.57 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  40.38 
 
 
205 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  34.21 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  37.18 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  42.31 
 
 
199 aa  53.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  44.23 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  50 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  41.27 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  37.18 
 
 
198 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  48.08 
 
 
104 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  38.46 
 
 
220 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  39.68 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  37.14 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  40.38 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  40.38 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  40.38 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  36.23 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  40.32 
 
 
236 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  41.18 
 
 
186 aa  50.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  37.66 
 
 
454 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  39.13 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  38.46 
 
 
221 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  41.07 
 
 
315 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  38.33 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  30.67 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  40.38 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  38.33 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  38.46 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  38.46 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  41.3 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  38.57 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  31.88 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  33.33 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  45 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  38.18 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  34.12 
 
 
185 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  37.04 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  42.11 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  45 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  36.36 
 
 
427 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  36.21 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  43.9 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  36.21 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  40.74 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  42.55 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  41.67 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  34.92 
 
 
427 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  45.45 
 
 
189 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  42 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  38.33 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.04 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  38.33 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  38.33 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.89 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  30.12 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  41.67 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  44.23 
 
 
1395 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  36.84 
 
 
435 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  30.67 
 
 
292 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  30.67 
 
 
295 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  30.67 
 
 
292 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  30.67 
 
 
292 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  31.34 
 
 
1138 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  38.33 
 
 
459 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  31.88 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  42.55 
 
 
438 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  40 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  40.74 
 
 
471 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4124  HNH nuclease  44.44 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000599297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  34.18 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  44.68 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  40.91 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  45.24 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  33.8 
 
 
459 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  37.93 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  40.32 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.67 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  37.93 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>