49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2175 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  70.79 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  71.59 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  71.59 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  71.59 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  67.42 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  64.21 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  65.59 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  60.19 
 
 		 113 aa  116  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.18 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  37.18 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.9 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  34.02 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  38.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.88 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.31 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.71 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  38.6 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.6 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  36.36 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  39.39 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  24.51 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  33.85 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  42 
 
 		 427 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 459 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  39.34 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.88 
 
 		 133 aa  43.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 459 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  30.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.36 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 427 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2805  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.4769199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4124  HNH nuclease  36.92 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000599297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  35 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 427 aa  40.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  33.7 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  33.7 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  32.86 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  36.21 
 
 		 471 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  46.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  35.48 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  35.48 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  35.48 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  31.43 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  35.48 
 
 		 295 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 198 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>