208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2934 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  100 
 
 
102 aa  213  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  63.37 
 
 
104 aa  150  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  65.98 
 
 
101 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  62.89 
 
 
105 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  79.73 
 
 
103 aa  135  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  53.54 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  56.84 
 
 
96 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  56.18 
 
 
92 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  68.42 
 
 
101 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  67.37 
 
 
101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  46.25 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  46.55 
 
 
185 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  49.06 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  52.08 
 
 
181 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  40.62 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  36.67 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  56.82 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  45.31 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  44.23 
 
 
236 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  53.49 
 
 
194 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  42.86 
 
 
196 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  37.5 
 
 
185 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  50 
 
 
179 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  50 
 
 
171 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  48.21 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  40.48 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  42.86 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  42.86 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  49.09 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  43.1 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  42.55 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  48.84 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  46.51 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  42.62 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  42.19 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  48.84 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  48 
 
 
197 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  39.06 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  48 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  35.94 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  32.56 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  39.06 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  47.27 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  42.19 
 
 
189 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  49.02 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  44.64 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  42.37 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  43.75 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  44 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  48.84 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  41.27 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  41.27 
 
 
204 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  42.86 
 
 
182 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  42.86 
 
 
182 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  41.38 
 
 
168 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  42.86 
 
 
182 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  41.38 
 
 
197 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  35.94 
 
 
185 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  35 
 
 
185 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  35.94 
 
 
202 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  46 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  51.16 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  42.86 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  51.16 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  46 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  50 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  42.86 
 
 
459 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  43.55 
 
 
193 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  45.61 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  49.12 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  44 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  40 
 
 
198 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  51.16 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  48.89 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  46 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  32.56 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  34.44 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.79 
 
 
1395 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  50 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  40.62 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  34.38 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  42.37 
 
 
122 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  40.62 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  34.38 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  40.74 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  46.94 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  50 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  41.89 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.38 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  47.92 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  43.64 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  34.83 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  45.1 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  45.83 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  38.46 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  44.44 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  38.46 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  42 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  48.84 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  45.1 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>