130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1723 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  100 
 
 		 113 aa  233  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  66.67 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  66.67 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  66.67 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  64.71 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  64.71 
 
 		 122 aa  116  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  61.36 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  57.89 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  60.71 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  60.47 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.74 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.25 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  41.25 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  38.75 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  36.25 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.71 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.25 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  36.25 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  53.19 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  57.14 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.25 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.25 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 427 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  54.76 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  50 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  40.74 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  38.16 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  50 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  55.81 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  37.66 
 
 		 459 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  36.47 
 
 		 459 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  51.11 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  51.11 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.74 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.74 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  51.22 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  46.81 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  52.5 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  30.61 
 
 		 236 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  52 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  53.33 
 
 		 204 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  49.06 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  37.93 
 
 		 471 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  50 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  52.27 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  52.27 
 
 		 168 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  52.27 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  44.44 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  50 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.5 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  58.54 
 
 		 177 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  52.38 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  50 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  47.5 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  46 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  40 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  45 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  58.54 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  54.76 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  51.22 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  40 
 
 		 198 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  50 
 
 		 170 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  50 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  48 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  45 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 443 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>