147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3842 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  70.79 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  70.79 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  70.79 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  72.22 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  66.67 
 
 		 149 aa  136  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  65.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  65.59 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  64.71 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  36.84 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.84 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  46.27 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  38.14 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.14 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.05 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  39.44 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.05 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.08 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  34.02 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.08 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  42.47 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  34.02 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.13 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  50 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  36.67 
 
 		 422 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.13 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  58.54 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 427 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 189 aa  48.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  56.1 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  53.66 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  51.22 
 
 		 443 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  36 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 459 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  56.1 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.13 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  53.66 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  51.22 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  51.22 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  38.46 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  53.49 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  35.79 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  35.21 
 
 		 435 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 459 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  50 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  53.49 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  51.16 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  36.67 
 
 		 471 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  51.22 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  51.22 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  38 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  56.1 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  51.22 
 
 		 167 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  47.06 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.19 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  53.66 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  42.25 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  42.37 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 481 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.19 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  51.92 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  56.1 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4124  HNH nuclease  37.14 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000599297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  51.92 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  46.51 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  46.34 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 464 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  50 
 
 		 354 aa  42  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  58.54 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  48.84 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>