214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0423 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  83.24 
 
 		 185 aa  320  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  57.07 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  53.51 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  58.47 
 
 		 185 aa  217  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  52.46 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  56.28 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  56.28 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  58.79 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  55.19 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  56.28 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  51.91 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  54.64 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  56.28 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  53.59 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  52.46 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  52.46 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  51.6 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  49.46 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  53.98 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  51.91 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  53.98 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  51.37 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  51.41 
 
 		 189 aa  187  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  51.7 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  47.8 
 
 		 194 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  50.29 
 
 		 191 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  44.86 
 
 		 194 aa  164  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  47.4 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  40.23 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  43 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  42.16 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  42.16 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  42.16 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  39.37 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  38.58 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  36.42 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  41.44 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  36.42 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  37.5 
 
 		 174 aa  84.3  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  30.97 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  45.98 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  35.92 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.33 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  37.09 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.44 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  38 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  37.33 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  48.1 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  48.81 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  35.98 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  49.33 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  50 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  36.6 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  37.25 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  49.3 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  45.45 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  40.74 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  46.05 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  40.2 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.92 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  34.67 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  47.62 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  46.91 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  41 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  35.76 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  44.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  43.59 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  49.38 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  45.45 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  36.79 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.16 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  35.19 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  36.79 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  28.66 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  43.82 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>