220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  100 
 
 
175 aa  360  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  43.98 
 
 
148 aa  100  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  38.04 
 
 
152 aa  99  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  37.29 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  34.38 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  39.88 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  34.38 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.57 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  36.25 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  37.65 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  37.5 
 
 
197 aa  89  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  38.79 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  36.2 
 
 
189 aa  87.8  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  36.97 
 
 
171 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  49.43 
 
 
177 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  34.97 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  33.74 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  32.5 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.4 
 
 
166 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  45.28 
 
 
198 aa  84.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  34.57 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  39.82 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  32.5 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  54.22 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  33.12 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  36.94 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  33.95 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  34.57 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  30.77 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  40.41 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  34.29 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  43.4 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  44.35 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  43.4 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  32.5 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  31.17 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  33.95 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  44.35 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  33.33 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  33.33 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  33.52 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  33.33 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  33.33 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  43.93 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  44.44 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  33.12 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  35.03 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  42.45 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  31.48 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  32.7 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  42.45 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  46.99 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  37.74 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  47.06 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  47.06 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  42.99 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  32.7 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  42.17 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  46.6 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  44.71 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  32.72 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  33.96 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  45.57 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  45.12 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  45.68 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  46.05 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  45.45 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  44.87 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  43.37 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  40.74 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  35.03 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  44.05 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  44.19 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  45.45 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  44.19 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  44.19 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  40.96 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  38.18 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  46.75 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  47.44 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  44.58 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  38.06 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  44.58 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  43.21 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  37.96 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  36.69 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  39.02 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  38.68 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  43.59 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  43.82 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  46.75 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  32.1 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  32.72 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.76 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  39.76 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  46.75 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  45.24 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  33.33 
 
 
221 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  43.21 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  37.74 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>