224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4034 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  83.24 
 
 		 185 aa  320  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  51.37 
 
 		 189 aa  208  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  55.19 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  54.64 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  54.64 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  50.27 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  56.59 
 
 		 202 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  54.1 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  54.1 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  51.37 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  48.63 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  51.91 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  50.27 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  51.93 
 
 		 221 aa  190  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  54.55 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  52.87 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  50.82 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  48.63 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  48.09 
 
 		 186 aa  180  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  46.28 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  44.57 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  44.74 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  42.86 
 
 		 194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  46.24 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  46.82 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  41.58 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  43.68 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  30.97 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  37.17 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  37.17 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  38.74 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  37.17 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  36.42 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  40.59 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  38.05 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  33.97 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  38.89 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  40.21 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  32.85 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  43.9 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  34.95 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  36.28 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  39.83 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  34.91 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  36.28 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  31.01 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  37.29 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  32.12 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  42.7 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  32.12 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  31.01 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  45.57 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  47.13 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  46.91 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.92 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  40.34 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  30.13 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.16 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  46.91 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  41.57 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  44.09 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  34.26 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  40.74 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  34.09 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  34.75 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  46.48 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  36.73 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  46.05 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  45.68 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  36.73 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  36.73 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  39.51 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  46.67 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  40.45 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  49.28 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  36.94 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  51.47 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  37.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>