227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3215 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  48.04 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  48.02 
 
 		 184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  45.76 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  45.9 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  47.46 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  46.89 
 
 		 186 aa  158  6e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  46.89 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  41.67 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  43.1 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  45.14 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  43.33 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  43.58 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  41.36 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  43.68 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  42.2 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  42.2 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  42.2 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  40.46 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  40.46 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  39.31 
 
 		 185 aa  130  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  40.23 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  37.57 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  38.73 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  36.63 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  37.42 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  36.16 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  34.15 
 
 		 165 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  51.32 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  35.1 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  33.54 
 
 		 165 aa  85.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  30.52 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  34.44 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  31.95 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  31.13 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  51.32 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  51.32 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.77 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  35.1 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  35.1 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  40.57 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  42.53 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  47.89 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  32.45 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  33.77 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  36.24 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  40.59 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  45.24 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  30.43 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  45 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  29.7 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  29.19 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  36 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  42.35 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  35.88 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  45 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  45 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  31.71 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  35.88 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  36 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  33.53 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  41.58 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  34.85 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  33.9 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  31.28 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  45.24 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  30.72 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  34.25 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  35.33 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  48.1 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  34.25 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  34 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  46.84 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  41.58 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  34.42 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  44.87 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>