201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1358 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  100 
 
 		 136 aa  286  6e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  95.59 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  72.79 
 
 		 135 aa  213  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  69.85 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  78.99 
 
 		 133 aa  207  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  72.88 
 
 		 131 aa  197  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  70.77 
 
 		 133 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  67.69 
 
 		 133 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  65.15 
 
 		 133 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  73.68 
 
 		 133 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  63.06 
 
 		 113 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  58.41 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  57.66 
 
 		 113 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  57.66 
 
 		 113 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  46.88 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  52 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  37.89 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  52.94 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  51.92 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  51.92 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  45.31 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  51.67 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  50 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 200 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  56.1 
 
 		 220 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  41.25 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  41.25 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  43.86 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  54.35 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  54.76 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  54.76 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  54.76 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  35.56 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  39.74 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  53.66 
 
 		 221 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  58.54 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  56.1 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  43.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  39.24 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  46.67 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  45 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  53.85 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  53.66 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  43.55 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  53.66 
 
 		 205 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  43.55 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  43.55 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  41.18 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  39.24 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 354 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  45 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 459 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  52.94 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  42.11 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 459 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  31.36 
 
 		 427 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  35.63 
 
 		 459 aa  48.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  55.32 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  51.02 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  54.76 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  37.66 
 
 		 454 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  54.17 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  46.43 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  38.82 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  47.73 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>