83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4058 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  100 
 
 
149 aa  299  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  88.43 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  73.23 
 
 
128 aa  163  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  73.23 
 
 
128 aa  163  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  72.44 
 
 
128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  66.32 
 
 
138 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  70.79 
 
 
122 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  64.21 
 
 
124 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  61.36 
 
 
113 aa  116  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  43.86 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.11 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.96 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  43.28 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.96 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.26 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  39.47 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  34.57 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  36.36 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  37.33 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.16 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  34.29 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.36 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  31.33 
 
 
174 aa  47.4  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.36 
 
 
113 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.84 
 
 
133 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  37.8 
 
 
427 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  38.36 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  35 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.84 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  46.3 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  46.51 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  48.84 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  37.31 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  44 
 
 
459 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  45.9 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  53.49 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  51.22 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  48.89 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  44 
 
 
459 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  46.67 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  48.89 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  40.82 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  23.58 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  38.98 
 
 
105 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  47.06 
 
 
220 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  51.16 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  46.51 
 
 
443 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.86 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  43.4 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  38.98 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  31.88 
 
 
427 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  34.62 
 
 
236 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  42.22 
 
 
168 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  39.73 
 
 
107 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  45.1 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  42.22 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  30.36 
 
 
427 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  47.62 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  53.66 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  53.66 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  44.19 
 
 
165 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  32.14 
 
 
471 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  45.1 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  48.84 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  43.64 
 
 
222 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  43.64 
 
 
222 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  45.65 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  43.64 
 
 
222 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  46.51 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  42.59 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  40 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  46.67 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  45.65 
 
 
182 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  33.9 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  46.67 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  45.65 
 
 
182 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  45.65 
 
 
183 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  46.67 
 
 
182 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  46.51 
 
 
198 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  36.07 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  26.92 
 
 
315 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  32 
 
 
438 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>