23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3731 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  100 
 
 		 151 aa  315  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4132  HNH endonuclease  47.29 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  hitchhiker  0.0000000241195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2428  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1019  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6796  hypothetical protein  40.88 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3829  HNH endonuclease  38.13 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000197518 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4938  HNH endonuclease  39.53 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000503137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4937  HNH endonuclease  40.6 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000289961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0088  hypothetical protein  37.01 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  35 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  36.25 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  33.73 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  30.53 
 
 		 459 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  33.75 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  32.65 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  32.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  32.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  29.76 
 
 		 102 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  27.27 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 443 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  27.71 
 
 		 178 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  38.18 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>