159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1198 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  42.03 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  35.87 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  40.68 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  38.27 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 459 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 459 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 465 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 465 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  43.28 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  43.28 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  43.28 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  32.35 
 
 		 471 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  32.05 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  36.51 
 
 		 435 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  35.94 
 
 		 454 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  38.1 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  40 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  32.31 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  28.26 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  35.71 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.93 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  40.35 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  35.71 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  31.08 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  31.46 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  40.58 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 216 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  32.81 
 
 		 427 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  40 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  40 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  36.36 
 
 		 422 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  33.9 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  36 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  33.93 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 2286 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  31.33 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  39.29 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  42 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  42 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  42 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  42 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  34.55 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  30.16 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  34.55 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  34.15 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 1138 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  31.43 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  31.88 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  35.19 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  34.48 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  35.19 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  33.93 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 443 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4938  HNH endonuclease  32.71 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000503137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>