83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5481 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  73.29 
 
 		 452 aa  634    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  100 
 
 		 465 aa  958    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  90.97 
 
 		 465 aa  848    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  71.09 
 
 		 477 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  68.6 
 
 		 464 aa  634  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  68.39 
 
 		 481 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  60.64 
 
 		 459 aa  542  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  61.85 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  63.26 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  51.52 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  52.57 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  52.91 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  52.81 
 
 		 422 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  51.28 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  50.69 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  46.7 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  44.59 
 
 		 459 aa  349  6e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  43.94 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  43.11 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  89.47 
 
 		 299 aa  326  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  47.68 
 
 		 459 aa  323  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  33.64 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  30.39 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  27.49 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  30.51 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  29.07 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  29.07 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 170 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 164 aa  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  44 
 
 		 198 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 172 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  33.9 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  30.21 
 
 		 552 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 171 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  36.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 102 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  42.86 
 
 		 168 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.9 
 
 		 187 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 173 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 81 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  33.9 
 
 		 185 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  28.92 
 
 		 168 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 1138 aa  46.6  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  40 
 
 		 354 aa  46.6  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  37.25 
 
 		 189 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 180 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 80 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  44.68 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  44.68 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  33.9 
 
 		 185 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 80 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  40 
 
 		 174 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  30.3 
 
 		 160 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  42.55 
 
 		 176 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  32.2 
 
 		 165 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  32.2 
 
 		 168 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 170 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 174 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  28.42 
 
 		 168 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  32.2 
 
 		 165 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 169 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  35.42 
 
 		 177 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  29.75 
 
 		 199 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  37.29 
 
 		 184 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  38.03 
 
 		 172 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 168 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 186 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 189 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  33.9 
 
 		 185 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  35 
 
 		 164 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 221 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  44 
 
 		 143 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  39.13 
 
 		 122 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1599  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 165 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  40 
 
 		 199 aa  43.5  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 182 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 165 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>