75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2057 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  100 
 
 		 295 aa  620  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  99.66 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  98.29 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  98.29 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2805  hypothetical protein  41.76 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.4769199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 1138 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  26.5 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  34.51 
 
 		 164 aa  52.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 192 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 459 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  33.71 
 
 		 174 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  40.3 
 
 		 194 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  40 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 		 435 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  38.16 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  36.07 
 
 		 471 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 102 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  36.84 
 
 		 101 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 103 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  30.07 
 
 		 459 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 104 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  31.43 
 
 		 193 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  31.18 
 
 		 461 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 186 aa  45.8  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  39.22 
 
 		 96 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  46.67 
 
 		 198 aa  45.8  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  29.91 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  32.1 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 427 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  35.94 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  38.1 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  36.51 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  42 
 
 		 102 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  45 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  30.67 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 174 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  37.29 
 
 		 104 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  35 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  29.41 
 
 		 443 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 552 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 92 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  31.67 
 
 		 1187 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  30.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  31.94 
 
 		 452 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  43.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 146 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  29.63 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 189 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 139 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  30.11 
 
 		 477 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  38.81 
 
 		 168 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 459 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 194 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 186 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0084  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 197 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 189 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  40.38 
 
 		 194 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 170 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  37.25 
 
 		 182 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>