92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5402 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  71.31 
 
 		 477 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  90.97 
 
 		 465 aa  846    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  100 
 
 		 465 aa  954    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  74.43 
 
 		 452 aa  646    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  67.74 
 
 		 464 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  67.31 
 
 		 481 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  62.72 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  59.79 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  64.19 
 
 		 454 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  49.45 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  53.04 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  51.98 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  53.53 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  49.53 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  46.47 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  50.46 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  99.47 
 
 		 299 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  45.56 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  43.24 
 
 		 443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  48.66 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  32.4 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  29.46 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  29.06 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  29.24 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  26.43 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  27.48 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  28.12 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 170 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  32.65 
 
 		 164 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 174 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  46 
 
 		 198 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 172 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  35.59 
 
 		 174 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  44.9 
 
 		 168 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  38.33 
 
 		 184 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  35.59 
 
 		 187 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  35.59 
 
 		 185 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 552 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 81 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 102 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 169 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  39.22 
 
 		 189 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  35.59 
 
 		 168 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  32.14 
 
 		 1138 aa  48.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  35.59 
 
 		 185 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 166 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  30.39 
 
 		 160 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 170 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 176 aa  47  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  33.9 
 
 		 168 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 80 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 80 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  40 
 
 		 354 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  28.42 
 
 		 168 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  43.75 
 
 		 177 aa  47  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  39.58 
 
 		 174 aa  46.6  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 174 aa  46.6  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 200 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  41.67 
 
 		 176 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  33.9 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  33.9 
 
 		 165 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  38.98 
 
 		 184 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 182 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 189 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 169 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 168 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  35.59 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 177 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  42 
 
 		 199 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  35 
 
 		 180 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 165 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 165 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 186 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  37.93 
 
 		 196 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 152 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  38 
 
 		 189 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  44 
 
 		 187 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  23.51 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  23.51 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  32.98 
 
 		 299 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  44 
 
 		 143 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 211 aa  43.5  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 178 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 170 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  33.9 
 
 		 171 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  33.9 
 
 		 165 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  36.67 
 
 		 164 aa  43.5  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  43.1  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>