155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4075 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  100 
 
 		 459 aa  915    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  62.88 
 
 		 435 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  65.34 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  49.55 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  49.2 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 481 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  46.03 
 
 		 464 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  47.61 
 
 		 452 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  45.89 
 
 		 477 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  42.03 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  48.48 
 
 		 465 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  43.19 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  47.55 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  46.85 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  42.99 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  41.06 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  40.89 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  42.98 
 
 		 459 aa  295  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  42.54 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  30.12 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  28.7 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  29.32 
 
 		 422 aa  133  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  46.35 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  34.69 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  33.74 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 234 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  45.76 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  45.76 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  50 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 		 187 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  40.68 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  52.27 
 
 		 174 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  48.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 		 168 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  47.06 
 
 		 189 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 167 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 165 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  40.68 
 
 		 165 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 173 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 170 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 168 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  47.46 
 
 		 184 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  34.04 
 
 		 552 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  48 
 
 		 198 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  40.68 
 
 		 174 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 166 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 170 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  46.67 
 
 		 122 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 166 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 174 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 222 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 222 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 222 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 178 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 151 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  24.8 
 
 		 222 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 174 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  51.11 
 
 		 198 aa  50.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  53.66 
 
 		 168 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 169 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 183 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 177 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 81 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 199 aa  49.3  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 165 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 165 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 180 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 166 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  40 
 
 		 1138 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.63 
 
 		 136 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 162 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 169 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  35.63 
 
 		 136 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 169 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 171 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  43.75 
 
 		 194 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 194 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 102 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 169 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  46.94 
 
 		 166 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  43.33 
 
 		 184 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  31.58 
 
 		 136 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  32.18 
 
 		 131 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 182 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  33.33 
 
 		 133 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 220 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  44 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  51.02 
 
 		 166 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  50 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>