14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4938 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4938  HNH endonuclease  100 
 
 		 122 aa  256  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000503137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4937  HNH endonuclease  49.25 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000289961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1019  HNH endonuclease  50 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4132  HNH endonuclease  43.51 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  hitchhiker  0.0000000241195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2428  HNH endonuclease  41.09 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  39.53 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6796  hypothetical protein  36.84 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3829  HNH endonuclease  38.4 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000197518 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0088  hypothetical protein  37.32 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0586  HNH nuclease  33.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  32.71 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  37.5 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  32.94 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>