10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4132 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4132  HNH endonuclease  100 
 
 		 135 aa  283  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  hitchhiker  0.0000000241195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2428  HNH endonuclease  56.82 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  47.29 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4937  HNH endonuclease  51.15 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000289961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1019  HNH endonuclease  48.03 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3829  HNH endonuclease  47.54 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000197518 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4938  HNH endonuclease  43.51 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000503137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6796  hypothetical protein  39.85 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463397  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0586  HNH nuclease  36 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>