17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0586 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0586  HNH nuclease  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1019  HNH endonuclease  32.89 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  31.96 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  30.36 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  30.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4132  HNH endonuclease  36 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  hitchhiker  0.0000000241195 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4938  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000503137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2428  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4937  HNH endonuclease  27.78 
 
 		 142 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000289961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  37.97 
 
 		 197 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  41.38 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  32 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  37.35 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>