11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2428 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2428  HNH endonuclease  100 
 
 		 144 aa  303  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4132  HNH endonuclease  56.82 
 
 		 135 aa  163  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  hitchhiker  0.0000000241195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3829  HNH endonuclease  55.74 
 
 		 125 aa  143  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000197518 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6796  hypothetical protein  48.48 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463397  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4937  HNH endonuclease  50 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000289961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1019  HNH endonuclease  47.69 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0088  hypothetical protein  42.31 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4938  HNH endonuclease  41.09 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000503137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0586  HNH nuclease  31.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>