22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0022 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  31.97 
 
 		 769 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  31.12 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  27.03 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  29.27 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  46.27 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  25.77 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  26.82 
 
 		 736 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  26.16 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  27.46 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2904  hypothetical protein  35.29 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0796384  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 709 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  23.48 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  43.75 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  26.44 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1599  hypothetical protein  35.62 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  25.9 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2696  hypothetical protein  27.78 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.258653  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  28.31 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  29.79 
 
 		 454 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  32.98 
 
 		 465 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>