173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1365 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  78.08 
 
 		 454 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 		 471 aa  973    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  63.98 
 
 		 464 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  64.62 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  63.73 
 
 		 477 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  65.18 
 
 		 452 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  63.01 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  62.15 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  61.3 
 
 		 459 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  55.5 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  55.56 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  55.5 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  53.56 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  49.32 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  55.11 
 
 		 422 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  53.29 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  47.4 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  48.42 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 459 aa  392  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  49.78 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  66.32 
 
 		 299 aa  236  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  33.63 
 
 		 422 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  30.57 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  30.91 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  31.79 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  31.79 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 234 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  32.88 
 
 		 199 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  43.28 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  40.58 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  50 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 172 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  55.81 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  48.15 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 1138 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  46.3 
 
 		 174 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  50.91 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 354 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  25.09 
 
 		 471 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  25.09 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  32.65 
 
 		 164 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  40.22 
 
 		 184 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  36.46 
 
 		 169 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 166 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 166 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 171 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 185 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 		 185 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 185 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 170 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  46.3 
 
 		 165 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  52.27 
 
 		 168 aa  54.3  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  39.39 
 
 		 187 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  52.17 
 
 		 189 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  32.22 
 
 		 169 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  31.82 
 
 		 189 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  33.66 
 
 		 160 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 165 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 165 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 80 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 80 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  51.02 
 
 		 185 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  35.87 
 
 		 122 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 168 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 81 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  52.08 
 
 		 185 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 185 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  47.83 
 
 		 193 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 167 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 315 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 165 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 165 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 171 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  52.08 
 
 		 185 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 142 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  44 
 
 		 197 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  44 
 
 		 168 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  37.21 
 
 		 177 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 173 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 178 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 213 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  36.07 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  36.07 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  36.07 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  36.07 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 165 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  39.53 
 
 		 196 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 170 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 81 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  44 
 
 		 174 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 102 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0084  restriction endonuclease  36.67 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 182 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 180 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  31.63 
 
 		 174 aa  47.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>