47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1156 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  100 
 
 
422 aa  873    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  88.99 
 
 
436 aa  798    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  60.54 
 
 
408 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  58.18 
 
 
222 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  33.7 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  33.92 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  31.82 
 
 
481 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  33.43 
 
 
464 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  30.91 
 
 
452 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  34.03 
 
 
477 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  32.74 
 
 
471 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  35.76 
 
 
427 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  33.54 
 
 
459 aa  156  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  31.47 
 
 
443 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  33.82 
 
 
438 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  32.4 
 
 
465 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  36.79 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  34.89 
 
 
427 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  32.3 
 
 
465 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  31.55 
 
 
454 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  35.6 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  32.21 
 
 
435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  29.32 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  31.34 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  31.1 
 
 
388 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  28.47 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  35.68 
 
 
234 aa  106  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  33.85 
 
 
299 aa  99.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  23.62 
 
 
471 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  23.62 
 
 
471 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  42.67 
 
 
199 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0119  putative type IV secretion system protein IcmJ/DotN  41.54 
 
 
239 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4433  hypothetical protein  35.29 
 
 
190 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  50 
 
 
80 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  50 
 
 
80 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  42.03 
 
 
221 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  42.62 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  40.32 
 
 
309 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  39.51 
 
 
163 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  40.32 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  40.32 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  44.44 
 
 
81 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  41.27 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  33.85 
 
 
226 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  35.38 
 
 
84 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  27.27 
 
 
174 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  41.07 
 
 
143 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>