23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2443 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  100 
 
 
471 aa  978    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  99.79 
 
 
471 aa  975    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  26.32 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  34.58 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  23.12 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  25.72 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  55.81 
 
 
234 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  25.09 
 
 
471 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  25.48 
 
 
459 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  23.85 
 
 
459 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  26.28 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  21.38 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5097  hypothetical protein  40.48 
 
 
193 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00104603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  38.1 
 
 
282 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  25.36 
 
 
464 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  23.68 
 
 
408 aa  46.6  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  28.29 
 
 
515 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  23.94 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  23.95 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  54.29 
 
 
177 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  26.64 
 
 
459 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  24.72 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  32.26 
 
 
585 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>