122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0841 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  85.22 
 
 
387 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  86.03 
 
 
388 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  34.51 
 
 
436 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  37.77 
 
 
427 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  37.29 
 
 
438 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  36.17 
 
 
427 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  35.68 
 
 
422 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  34.89 
 
 
427 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  38.72 
 
 
459 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  38.08 
 
 
408 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  37.08 
 
 
481 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  36.51 
 
 
435 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  35.37 
 
 
471 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  35.47 
 
 
443 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  39.15 
 
 
459 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  35.42 
 
 
464 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  36.51 
 
 
459 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  29.55 
 
 
452 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 
454 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  31.17 
 
 
477 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  32.77 
 
 
459 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  30.77 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  38.93 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  31.65 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  32.55 
 
 
422 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  26.67 
 
 
471 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  26.67 
 
 
471 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  30.93 
 
 
465 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  49.06 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  38.64 
 
 
321 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  39.29 
 
 
260 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  50 
 
 
166 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5097  hypothetical protein  47.5 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00104603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  52.38 
 
 
162 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  35.56 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  49.06 
 
 
282 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  45.28 
 
 
309 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  28.69 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  40 
 
 
189 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  50 
 
 
177 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  34.12 
 
 
330 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  34.15 
 
 
232 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  52.38 
 
 
123 aa  48.5  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  44.23 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  42.62 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  37.14 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  31.71 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  37.25 
 
 
173 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  41.82 
 
 
143 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  46.94 
 
 
84 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  39.68 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  32.04 
 
 
299 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  41.77 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  35.4 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  44 
 
 
181 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  36.84 
 
 
278 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  40.98 
 
 
299 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  43.64 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  38.71 
 
 
143 aa  45.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  35.71 
 
 
185 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4442  HNH endonuclease  47.27 
 
 
567 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.93 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  39.66 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  40.82 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  36.07 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0527  HNH endonuclease  40.54 
 
 
365 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.991907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  35.09 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  48.28 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  38.46 
 
 
80 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  42 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  51.11 
 
 
386 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  38.46 
 
 
80 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  51.61 
 
 
115 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  46.94 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  35.82 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  40.82 
 
 
185 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  40.82 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  40 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  44.78 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  35.29 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  36.21 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  50 
 
 
119 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  37.1 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  53.12 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  50.98 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  44 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  40 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  42 
 
 
174 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  44 
 
 
167 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  40 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  36.07 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  36.07 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  35.29 
 
 
169 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  48.89 
 
 
359 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  40 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40 
 
 
185 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  42 
 
 
167 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>