86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3306 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  100 
 
 
461 aa  956    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  62.26 
 
 
427 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  62.09 
 
 
427 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  55.73 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  54.55 
 
 
464 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  53.99 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  53.23 
 
 
454 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  52.01 
 
 
452 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  51.62 
 
 
438 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  53.41 
 
 
477 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  54.12 
 
 
459 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  52.68 
 
 
427 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  51.75 
 
 
465 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  49.67 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  50.97 
 
 
422 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  48.71 
 
 
435 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  48.83 
 
 
443 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  48.06 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  47.84 
 
 
459 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  43.19 
 
 
459 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  35.33 
 
 
436 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  36.16 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  36.79 
 
 
422 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  47.37 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  27.55 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  27.08 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  29.61 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  37.5 
 
 
199 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  38.98 
 
 
170 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  48.89 
 
 
170 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  26.4 
 
 
222 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  32 
 
 
172 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  32.14 
 
 
174 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  40.43 
 
 
174 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  46.55 
 
 
1138 aa  50.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  37.5 
 
 
168 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  42.86 
 
 
142 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 
168 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  43.64 
 
 
80 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.18 
 
 
171 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 
185 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  43.64 
 
 
80 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 
185 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  34.55 
 
 
168 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 
185 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  35.59 
 
 
168 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  29.41 
 
 
160 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  45.65 
 
 
189 aa  47  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  48.98 
 
 
143 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  33.33 
 
 
182 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  47.83 
 
 
189 aa  47  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  40.79 
 
 
216 aa  47  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  38.18 
 
 
166 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  36.62 
 
 
151 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  28.41 
 
 
168 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  32.93 
 
 
122 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44.64 
 
 
166 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  35.29 
 
 
354 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4619  HNH endonuclease  38.03 
 
 
143 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  31.18 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  35.59 
 
 
165 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  35.59 
 
 
165 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.93 
 
 
187 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  38.64 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  35.71 
 
 
169 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  33.8 
 
 
213 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  40.91 
 
 
189 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  44.44 
 
 
127 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  32 
 
 
192 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  36.36 
 
 
166 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  32.2 
 
 
165 aa  44.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  32.91 
 
 
292 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  32.91 
 
 
292 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  33.33 
 
 
221 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  32.91 
 
 
292 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  33.33 
 
 
174 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  36.36 
 
 
81 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  36.36 
 
 
169 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  32.1 
 
 
193 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  34.55 
 
 
552 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  39.34 
 
 
163 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  33.33 
 
 
164 aa  43.1  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  32.79 
 
 
171 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  36.36 
 
 
585 aa  43.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  44.68 
 
 
169 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  40.91 
 
 
174 aa  43.1  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>