135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0122 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  76.24 
 
 
427 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  100 
 
 
427 aa  883    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  62.09 
 
 
461 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  55.28 
 
 
471 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  52.97 
 
 
477 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  52.51 
 
 
452 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  53.26 
 
 
464 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  53.97 
 
 
481 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  50.34 
 
 
438 aa  428  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  52.57 
 
 
427 aa  421  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  49.77 
 
 
454 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  51.72 
 
 
465 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  52.91 
 
 
465 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  50 
 
 
459 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  47.67 
 
 
435 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  50.35 
 
 
443 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  47.87 
 
 
422 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  43.51 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  44.19 
 
 
459 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  40.89 
 
 
459 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  36.39 
 
 
436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  34.06 
 
 
422 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  50 
 
 
299 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  34.69 
 
 
408 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  36.17 
 
 
234 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  37.87 
 
 
388 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  37.77 
 
 
387 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  42.67 
 
 
170 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  41.67 
 
 
174 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.5 
 
 
172 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  51.02 
 
 
168 aa  57  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  38.03 
 
 
174 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  48.89 
 
 
170 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  44.64 
 
 
168 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  44.64 
 
 
171 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  36.62 
 
 
187 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  39.29 
 
 
168 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  36.62 
 
 
185 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  34.15 
 
 
168 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  36.67 
 
 
165 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  36.62 
 
 
185 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.5 
 
 
168 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  38.03 
 
 
165 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  38.03 
 
 
165 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  43.75 
 
 
189 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  32.14 
 
 
199 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  35.21 
 
 
165 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  36.67 
 
 
165 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  36.62 
 
 
185 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  33.66 
 
 
198 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  33.66 
 
 
198 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  35 
 
 
167 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  32.67 
 
 
204 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  33.66 
 
 
197 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.82 
 
 
169 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  26.85 
 
 
164 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  39.34 
 
 
169 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  33.8 
 
 
169 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.97 
 
 
185 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  33.33 
 
 
165 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  35.71 
 
 
321 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  32.1 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  40 
 
 
80 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  40 
 
 
80 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2805  hypothetical protein  34.43 
 
 
234 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.4769199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  34.18 
 
 
220 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  34.12 
 
 
166 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  39.58 
 
 
194 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  38.33 
 
 
194 aa  46.6  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  39.58 
 
 
194 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  40.43 
 
 
198 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  30.86 
 
 
166 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  36.36 
 
 
181 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  32 
 
 
166 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  38.89 
 
 
552 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  38.89 
 
 
166 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  36.51 
 
 
1138 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  45.24 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  37.93 
 
 
184 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  40.35 
 
 
142 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  35.29 
 
 
131 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.36 
 
 
113 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.36 
 
 
113 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  39.22 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  35.44 
 
 
216 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  37.78 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  37.78 
 
 
185 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  32.93 
 
 
174 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  33.8 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  35.59 
 
 
177 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  35.19 
 
 
171 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  29.41 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  42.86 
 
 
185 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  32.79 
 
 
220 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  41.46 
 
 
174 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  35.59 
 
 
139 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  35.85 
 
 
560 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  32.89 
 
 
182 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  32.79 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  40.91 
 
 
189 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>