84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2805 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2805  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.4769199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  41.76 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  41.76 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  41.76 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  41.76 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  47.27 
 
 		 172 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 477 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 427 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  37.31 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 452 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  34.09 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 427 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  35.14 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 1138 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  33.8 
 
 		 186 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 170 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 459 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 459 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  32.43 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  40 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  30.12 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  30.53 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  36.92 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  30.19 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  30.69 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  36.92 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  32.26 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  36.23 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  36.23 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  33.87 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  34.55 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  27.88 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 174 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  32.79 
 
 		 122 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  37.14 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  30.86 
 
 		 197 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 170 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 185 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 438 aa  42  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 188 aa  42  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 213 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 103 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  31.94 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  31.94 
 
 		 178 aa  41.6  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>