27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5452 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  99.47 
 
 		 465 aa  349  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  89.47 
 
 		 465 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  71.05 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  72.63 
 
 		 452 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  68.42 
 
 		 481 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  67.89 
 
 		 477 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  66.32 
 
 		 471 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  67.89 
 
 		 454 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  61.05 
 
 		 459 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  48.17 
 
 		 438 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  50.26 
 
 		 427 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  49.47 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  47.64 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  46.32 
 
 		 459 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  45.26 
 
 		 427 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  46.84 
 
 		 461 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 443 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  46.55 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  45.93 
 
 		 459 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 422 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  28.99 
 
 		 436 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  30.27 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  30.43 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 		 720 aa  42.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>