138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3410 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 		 422 aa  851    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  79.75 
 
 		 435 aa  627  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  65.5 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  53.94 
 
 		 481 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  55.56 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  53.11 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  54.24 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  54.66 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  53.47 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  52.32 
 
 		 465 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  50.97 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  54.01 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  50.61 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  48.49 
 
 		 427 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  47.52 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  48.74 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 438 aa  328  8e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  46.97 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  43.72 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 459 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  31.14 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  27.65 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  47.7 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  28.47 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  29.04 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  28.28 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  29.25 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 142 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  53.06 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  47.46 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  45.76 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 168 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  49.15 
 
 		 165 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  38.2 
 
 		 160 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  40.68 
 
 		 168 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  49.15 
 
 		 165 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  49.15 
 
 		 167 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  54.17 
 
 		 170 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  42.19 
 
 		 172 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  38.95 
 
 		 168 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 		 185 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 165 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  49.02 
 
 		 189 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 80 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 80 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 1138 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 		 185 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 185 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 173 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 164 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  38.98 
 
 		 187 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 165 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 165 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  42.37 
 
 		 174 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 170 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  45.76 
 
 		 184 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  55.1 
 
 		 189 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 166 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 174 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 166 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  46 
 
 		 198 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 81 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  50 
 
 		 168 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 166 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  37.35 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  38.16 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  37.35 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  37.35 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  51.02 
 
 		 185 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 81 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  34.65 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  26.06 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  26.06 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  48 
 
 		 204 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  39.66 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  38.03 
 
 		 138 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  48 
 
 		 198 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  48 
 
 		 198 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 199 aa  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 169 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 552 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.35 
 
 		 113 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 171 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  36 
 
 		 170 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  43.33 
 
 		 122 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 174 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 177 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  41.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 102 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 169 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 169 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  36.84 
 
 		 131 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  48.94 
 
 		 185 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>