90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1790 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  97.93 
 
 
388 aa  734    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  100 
 
 
387 aa  784    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  85.22 
 
 
234 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0843  hypothetical protein  82.64 
 
 
146 aa  245  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  30.09 
 
 
436 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  31.34 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  32.94 
 
 
427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  37.77 
 
 
427 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  34.73 
 
 
438 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  32.59 
 
 
408 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  34.69 
 
 
459 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  33.44 
 
 
443 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  33.44 
 
 
481 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  33.65 
 
 
435 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  31.79 
 
 
471 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  31.85 
 
 
459 aa  99.4  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  31.25 
 
 
459 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  34.04 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  32.18 
 
 
464 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  32.1 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  30.34 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  26.84 
 
 
461 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  25.62 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  25.86 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  28.7 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  29.17 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  50.7 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  28.97 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  29.39 
 
 
465 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  43.08 
 
 
163 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  29.71 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  48.33 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  42.11 
 
 
277 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  45.16 
 
 
177 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  35.96 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  46.94 
 
 
166 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  38.67 
 
 
240 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  45.76 
 
 
186 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  38.1 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  44.64 
 
 
561 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  33.33 
 
 
560 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  40 
 
 
309 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  38.1 
 
 
228 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  36.05 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  36.04 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  39.34 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  43.86 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  31.13 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  32.1 
 
 
260 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  42.86 
 
 
181 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  39.19 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  48.08 
 
 
162 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  37.1 
 
 
123 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  43.86 
 
 
165 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  35.53 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  32.22 
 
 
218 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5097  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00104603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  44.9 
 
 
169 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  46.94 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  46.94 
 
 
196 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  34.78 
 
 
171 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  48.98 
 
 
189 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  36.11 
 
 
220 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0994  HNH nuclease  46.03 
 
 
153 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2991  HNH nuclease  50.85 
 
 
584 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76476  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  38 
 
 
168 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  44.9 
 
 
185 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  40.28 
 
 
322 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  42.37 
 
 
165 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  47.92 
 
 
206 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  46 
 
 
167 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  33.94 
 
 
178 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  34 
 
 
204 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  39.02 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  31.25 
 
 
334 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  39.6 
 
 
130 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  39.71 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  34 
 
 
186 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  31.51 
 
 
1138 aa  43.5  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  46.94 
 
 
165 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.43 
 
 
607 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  37.84 
 
 
142 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  37.74 
 
 
585 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  37.74 
 
 
585 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.43 
 
 
607 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.43 
 
 
607 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.43 
 
 
607 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1011  hypothetical protein  46.38 
 
 
564 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  46 
 
 
165 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  42.62 
 
 
341 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>