232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1114 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  100 
 
 		 92 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  59.34 
 
 		 104 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  66.67 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  57.95 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  62.79 
 
 		 96 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  56.18 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  58.14 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  60.27 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  60.27 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  61.11 
 
 		 101 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  41.57 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  50.75 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  56.6 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  60.78 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  52.08 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  56.25 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  54.72 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  54.72 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  50 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  50.79 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  52.46 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  52 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  52 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  47.46 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  50 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  58.7 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  48.08 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  49.15 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  54 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  44.44 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  52.83 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  50.98 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  44.62 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  42.65 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  50.94 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  50.98 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  41.27 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  52.94 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  50 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  41.38 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  50.94 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  44.44 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  50.94 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  44.26 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.86 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  48 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  47.92 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  46.55 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  50.98 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  41.18 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.71 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.65 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 187 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  47.92 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  50 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  54.35 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  46 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  50 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  50 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  41.18 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  49.02 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  50 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  45.76 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.68 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  44.26 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.68 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  50 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  48.21 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  45.76 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  45.76 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.71 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  45.76 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  50.98 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>