77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3606 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  99.22 
 
 		 128 aa  253  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  73.23 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  75.65 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  69.23 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  69.66 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  71.59 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  66.67 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  43.55 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  41.94 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.62 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  41.27 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  43.55 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  27.45 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  41.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  38.33 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  40.32 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  30.11 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 236 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.33 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  38.33 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  39.34 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  47.73 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.32 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.33 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 		 220 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  42 
 
 		 427 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3731  HNH endonuclease  32.65 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323124  normal  0.326108 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  51.16 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 185 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  48.89 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 174 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  48 
 
 		 177 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  38.98 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  46.51 
 
 		 174 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 443 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  38 
 
 		 459 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  52.38 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  52.38 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  41.86 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  35.38 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  34 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 171 aa  40  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  38 
 
 		 459 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 166 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 184 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 168 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  46.67 
 
 		 184 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>