193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0033 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  100 
 
 
136 aa  286  9e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  86.32 
 
 
131 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  70.59 
 
 
136 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  78.33 
 
 
133 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  71.32 
 
 
135 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  69.85 
 
 
136 aa  208  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  70.73 
 
 
133 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  74.78 
 
 
133 aa  196  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  73.91 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  71.93 
 
 
133 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  64.86 
 
 
113 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  63.72 
 
 
113 aa  163  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  63.06 
 
 
113 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  63.06 
 
 
113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  40 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  37.78 
 
 
199 aa  62  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  46.15 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  34.65 
 
 
236 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  43.86 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  45.61 
 
 
184 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  41.82 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  45.16 
 
 
183 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  37.5 
 
 
220 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  40.35 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  42.19 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  40.79 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  50 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  40.62 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  34.62 
 
 
200 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  53.66 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  40.62 
 
 
222 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  40.62 
 
 
222 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  40.62 
 
 
222 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  42.31 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  42.86 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  44.44 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  34.74 
 
 
198 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  35.94 
 
 
221 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  47.83 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  51.22 
 
 
165 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  41.94 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  42.11 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  42.11 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  39.06 
 
 
222 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  42.11 
 
 
196 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  45.65 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  39.06 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  38.81 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  40.32 
 
 
197 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  53.49 
 
 
189 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  46.15 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  41.79 
 
 
198 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  40.35 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  36.25 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  48.78 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  42.59 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  40.74 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  36.92 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  37.84 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  45.1 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  46.43 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  42.59 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  48.89 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  48.84 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  41.79 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  41.38 
 
 
315 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  37.68 
 
 
198 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  36.36 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  36.36 
 
 
454 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  40.74 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  36.11 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  41.79 
 
 
198 aa  48.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  33.68 
 
 
427 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  38.89 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  36.92 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  41.51 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  37.74 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  36.92 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  48.84 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  46.51 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  32.91 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  37.5 
 
 
182 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  36.11 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  45.1 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  44.23 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  40 
 
 
107 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  47.62 
 
 
185 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  36.25 
 
 
459 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  44.64 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  36.11 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  38.1 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  35.71 
 
 
438 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  43.75 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  36.51 
 
 
174 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  36.11 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  34.72 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  35.44 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  36.36 
 
 
459 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  44.64 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  42.59 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>